MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_030

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017151	AGC	2	6	54	59	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017151	GCC	2	6	84	89	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017151	TAC	2	6	195	200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017151	ATGG	2	8	217	224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017151	TAAT	2	8	446	453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017151	CCAT	2	8	1089	1096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017151	CGC	2	6	1101	1106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017151	AT	3	6	1177	1182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017151	GGCA	2	8	1877	1884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017151	TCA	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017151	TTC	2	6	1920	1925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017151	T	6	6	2240	2245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017151	TGA	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017151	ATT	2	6	4004	4009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017151	AAT	2	6	6378	6383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017151	AAC	2	6	6562	6567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017151	GTT	2	6	6584	6589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017151	GTAAG	2	10	6599	6608	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017151	CT	4	8	6673	6680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017151	CAAT	2	8	6727	6734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017151	CTA	2	6	7018	7023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017151	GAA	2	6	7574	7579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017151	A	7	7	7647	7653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017151	G	6	6	9061	9066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017151	AAT	2	6	9494	9499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017151	CGA	2	6	9527	9532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017151	A	7	7	9532	9538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017151	G	6	6	9552	9557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017151	TGCC	2	8	12770	12777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017151	AGAT	2	8	15586	15593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017151	T	7	7	15676	15682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017151	ACT	2	6	15726	15731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017151	AC	3	6	15748	15753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017151	GCC	2	6	15810	15815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017151	CCG	2	6	15833	15838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017151	GCC	2	6	15853	15858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017151	C	7	7	15881	15887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_017151	TC	3	6	15976	15981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017151	AGA	2	6	16065	16070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017151	CAG	2	6	16123	16128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017151	GT	3	6	16185	16190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017151	CGTC	2	8	16292	16299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017151	TCC	3	9	16306	16314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017151	CACGTT	2	12	16440	16451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017151	GCTG	2	8	16574	16581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017151	CTG	2	6	17014	17019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017151	TGG	2	6	17050	17055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017151	TTA	2	6	17075	17080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017151	TAA	2	6	17087	17092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017151	T	6	6	17758	17763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017151	GGT	2	6	17774	17779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017151	T	8	8	17825	17832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017151	A	6	6	18498	18503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017151	GGA	2	6	19092	19097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017151	GAT	2	6	19713	19718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017151	GTGC	2	8	19975	19982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017151	AATC	2	8	20402	20409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017151	GC	3	6	20434	20439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017151	TTTATG	2	12	23601	23612	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017151	GGC	2	6	24595	24600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017151	TGG	2	6	24646	24651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017151	CTGT	2	8	24671	24678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017151	TCA	2	6	26378	26383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017151	GGC	2	6	26444	26449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017151	A	7	7	26467	26473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017151	TG	3	6	27015	27020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017151	TGC	2	6	27202	27207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017151	GCA	2	6	27215	27220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017151	GAAC	2	8	27226	27233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017151	TAAG	2	8	27255	27262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017151	GT	3	6	27328	27333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017151	GAA	2	6	27336	27341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017151	TGC	2	6	27353	27358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017151	AGAA	2	8	27480	27487	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017151	CGG	3	9	27539	27547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017151	TGA	2	6	27569	27574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017151	GATGC	2	10	27709	27718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017151	GT	3	6	27780	27785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017151	TG	3	6	27808	27813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017151	AG	3	6	27821	27826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017151	CT	3	6	27877	27882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017151	CTG	2	6	27884	27889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017151	CCA	2	6	27953	27958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017151	CGC	2	6	27980	27985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017151	TAG	2	6	28016	28021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017151	TCG	2	6	28033	28038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017151	GAT	2	6	28758	28763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017151	C	6	6	30100	30105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_017151	G	6	6	31279	31284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017151	CAT	2	6	31318	31323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017151	T	6	6	38468	38473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017151	TCT	2	6	38528	38533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017151	TCAG	2	8	38583	38590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017151	AGA	2	6	38713	38718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017151	TCT	2	6	38721	38726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017151	AGC	2	6	38737	38742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017151	TG	3	6	39300	39305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017151	T	6	6	39310	39315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017151	T	6	6	39321	39326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017151	CTT	2	6	39346	39351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017151	TGT	2	6	39363	39368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017151	T	6	6	39383	39388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017151	GTTT	2	8	39389	39396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017151	T	6	6	39438	39443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017151	TATGT	2	10	39447	39456	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017151	T	6	6	39471	39476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017151	CTCGCT	2	12	39503	39514	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017151	A	6	6	39544	39549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017151	CG	3	6	39690	39695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017151	AAT	2	6	39731	39736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017151	CGG	2	6	41042	41047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017151	GGCA	2	8	41051	41058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017151	TGG	2	6	41060	41065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017151	GGC	2	6	41665	41670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017151	TGG	2	6	41716	41721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017151	CTGT	2	8	41741	41748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017151	TGA	2	6	43149	43154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017151	TTTCT	2	10	43164	43173	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017151	TGA	2	6	43728	43733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017151	ATT	2	6	43786	43791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017151	CT	4	8	46020	46027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017151	CAAT	2	8	46074	46081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017151	A	7	7	46149	46155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017151	C	6	6	46249	46254	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_017151	GAG	2	6	46301	46306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017151	G	6	6	47428	47433	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017151	TGG	2	6	47458	47463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017151	ACA	2	6	47488	47493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017151	ATC	2	6	47533	47538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017151	ACG	2	6	48257	48262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017151	CTA	2	6	48275	48280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017151	GCG	2	6	48311	48316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017151	GGT	2	6	48336	48341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017151	CAG	2	6	48407	48412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017151	GA	3	6	48413	48418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017151	CT	3	6	48470	48475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017151	CA	3	6	48483	48488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017151	AC	3	6	48511	48516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017151	GCATC	2	10	48578	48587	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017151	ATC	2	6	48721	48726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017151	GCC	3	9	48748	48756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017151	TTTC	2	8	48808	48815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017151	GCA	2	6	48938	48943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017151	CTT	2	6	48954	48959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017151	AC	3	6	48963	48968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017151	CTTA	2	8	49034	49041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017151	GTTC	2	8	49063	49070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017151	TGC	2	6	49076	49081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017151	GCA	2	6	49089	49094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017151	AC	3	6	49275	49280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.